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"分子动力学与分子对接理论"学术讲座
时间:
2018/11/29
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2018年11月25日上午10点,张丽杰硕士受大阳城集团娱乐游戏大阳城集团娱乐游戏的应邀来我校讲学,张丽杰硕士以“分子动力学与分子对接理论”为题,为大家带来一场精彩绝伦的学术讲座。讲座由大阳城集团娱乐游戏湛洋博士主持、部分老师及全体研究生一同听取。
湛洋博士介绍到,张丽杰硕士是南开大学药学院硕士,现任职于贝瑞基因项目经理。2013年-2016年任职于北京市计算中心,担任生物信息工程师,主要从事基因测序数据分析、蛋白质结构分析、数据库构建及公共数据的挖掘。具有多年生物信息学领域研究经验;专长蛋白分子对接、分子动力学、蛋白结构分析、基因测序数据分析、公共数据库挖掘等。在《New England》 《Plos One》和《BMCL》等国际期刊上发表了多篇学术论文。
张丽杰硕士通过简单易懂的方法先介绍了分子对接原理,并进行分子对接方法分类。构象搜索方法,从遗传搜索,利用生物遗传,适者生存的方法来优化小分子的构象,第一步就是随机搜索相似,生成一定数量的合理构象,然后改变构象中的一些键的二面角,接着算能量。同时还介绍了代表性分子对接软件,以数据展示常用的分子对接软件被引用次数很高。最后着重介绍AutoDock软件,AutoDock是一款由C语言开发的免费分子对接软件,包括了两个程序:AutoGrid 格点中相关能量的计算,AutoDock 构象搜索及评价。张丽杰硕士还为同学们进行了一遍软件操作。到了答疑阶段,同学们按奈不住纷纷提出自己心中的疑惑,张丽杰硕士耐心的一一的进行了解答。这次学术讲座不仅使同学们拓展了知识面,同时老师们也从中学到了许多东西,张丽杰硕士最后由衷的祝愿老师、同学们学途永进。
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